মুক্তাগাছার পূর্ব নাম ছিল বিনোদবাড়ি। ময়মনসিংহ জেলা থেকে দশ মাইল পশ্চিমে এর অবস্থান।

রামরাম যখন বিনোদবাড়ি আসে তখন এটি ছিল কয়েকজন নিতান্তই দরিদ্র লোকের বাসস্থান। নতুন মালিক শ্রীকৃষ্ণ আচার্য্য উপস্থিত হলে তাকে দেখার জন্য গ্রামের সাধারন জনগন সাধ্যমত উপঢৌকন নিয়ে উপস্থিত হয়। এই-সব দ্রব্যের মাঝে মুক্তারাম কর্মকারের প্রদত্ত একটি গাছা (পিলসুজ) যা সর্বাপেক্ষা মূল্যবান ছিলো। আর সেই জন্য রামরাম মক্তারামের মুক্তা ও তাহার প্রদত্ত গাছা একত্র করে এই স্থানের নামকরন করেন মুক্তাগাছা।

১৮৭৫ সালে মুক্তাগাছায় মিউনিসিপ্যালিটি স্থাপিত হয়। পূর্বের আইন অনুসারে জেলা ম্যাজিস্ট্রেট পদাধিকার বলে মিউনিসিপ্যালিটির চেয়ারম্যান হতেন। পরে যখন চেয়ারম্যান র্নিবাচনের ব্যবস্থা হলে মহারাজা সূর্যকান্ত প্রথম চেয়ারম্যান হিসাবে নিযুক্ত হয়।

প্রথম বিশ্বযুদ্দের পর হতে শুরু করে দ্বিতীয় বিশ্বযুদ্ধের পর পর্যন্ত এর পরিধি ক্রমশ বাড়তেই থাকে। পাকিস্তান হবার পর হিন্দুরা চলে যেতে থাকলে এর বৃদ্ধি বাঁধা প্রাপ্ত হয়। তার পর থেকে এটি পুনরায় মুসলমান অধ্যুষিত এলাকা গড়ে উঠে।